Валерий Фомагин занял пост советника Главы города Сургута.

С 2016 по 2018 год он руководил Департаментом дорожного хозяйства и транспорта Югры, в 2018-2021 годах трудился генеральным директором АО «Государственная компания» «Северавтодор» (г. Сургут). В 2022-м, возглавив ООО «СПС Концессия № 1», занимался реализацией первого в округе концессионного соглашения по строительству автомобильной дороги, которое реализуется в городе Сургуте на пр. Комсомольском.

С марта по октябрь 2021 года в Администрации Сургута Валерий Фомагин работал в качестве заместителя Главы, в том числе курировал департамент архитектуры и градостроительства.